信息系统的战略性运用表现了这样一种变化：从纯粹的财务系统变为整合进企业经营中的系统。这些系统帮助企业控制商业跟踪、记录实时基础上的交易、控制流程，通常还包括在整合性的、复杂的系统环境中的许多经营行为。在生产过程中，信息系统支持生产的各个阶段。原料接受预测、要素的选择与结合、产品的质量控制、收据、存货更新、顾客记录以及产品的分配都可以运用这些系统。在多数情况下，这些步骤与过程控制系统和机械化操作的联系达到了这样一种程度，不需要人力就可以完成产品订单。一个整合的经营系统的效果是非常突出的，这正如在适时存货制度（JIT）中表现出来的那样。公司运用JIT保证最少的存货，可以显著地减少支出。采用JIT的企业大量依赖它们的信息系统来实现生产目标，因为没有信息系统，这样密切地监控是不可能实现的。通过頻繁地使用电子数据交换，信息系统本身就可以下命令并制定计划，使得原料自动到货。与之相同的多数新的生产系统与企业其他的系统（可能包括企业的财务系统）高度地整合为一体，当系统执行其他的运用时，财务数据和会计记录也会自动产生更新。
信息系统通常充分地结合到经营的多个方面。网络和基于网络的系统被很普遍地应用，许多公司有企业范围的信息系统，例如企业资源计划（ERP）。这些应用有助于获得以前被职能机构或部门所截留的信息，使它可以用于广泛的管理用途。在信息系统中交易可以被实时地记录和跟踪，从而使管理人员有效地获得财务和经营信息，来控制企业的经营活动。例如，一家从事多个大型项目的建筑公司使用一个整合的、基于广域网的信息系统，以满足市场和效率期望。这个系统使员工能够无缝隙地与建筑师和工程师、客户、分包商和监管者共亨当前的图纸，同时保持图纸的版本控制。帮助管理人员跟踪供应给客户的存货和部件，识别多个工地的物料供应过剩或短缺，从通用物料供应商处获取成本节约或者把类似的组织联合起来以获取批量折扣，以及监督分包商的活动。此外，这个系统还包含知识管理能力，它允许公司员工在整个组织中分享创新的解决方案。
历史数据使企业主体能够按照往期的任务、计划和期望来追踪实际的业绩。为了支持有效的企业风险管理，企业主体往往会获取和利用历史的和现在的数据。这些数据提供有关在不同的条件下主体如何表现的认识，使管理当局能够识别相互关系和趋势，并预测未来的业绩。历史数据还能够针对那些提请管理当局注意的潜在事项发出及早的警告。这些数据使管理当局能对一个过程、职能或单元范围内现有的风险取得一个实时的认识，并确定偏离期望的差异。现在或当前状态的数据则使一个主体能够确定它是否保持在既定的风险容限之内。随着新技术的兴起，组织利用新技术的能力也将随之提高，系统的复杂性和整合性也在持续。信息系统的发展提高了许多组织在整个企业的层次上计量和监控业绩以及提交分析性信息的能力。但是，在战略和经营层次对信息系统不断加大的依赖的同时，也带来了必须整合到主体的企业风险管理之中的新的风险——例如，信息安全故障或网络犯罪。
