在认证审核中，审核员主要开展活动是：
（1）查阅森林经营单位是否备有相关的动植物保护参考文件。
（2）通过查阅资料、访谈当地人员和fsc森林经营单位，确认森林经营单位的经营区域内是否存在着珍稀、受威胁和濒危动植物物种。
（3）如果存在着珍稀、受威胁和濒危动植物物种，则开展文件查阅和现地考察，检查fsc森林经营单位是否有相关的保护措施文件规定（如保护区设立的文件、禁止某些活动的文件），是否有明确相关的分布区域并加以标识，是否建立了适宜的保护区域和生物走廊带，是否有落实保护措施。
（4）通过访谈和当地市场实地考察，检查森林经营单位开发利用的物种，并分析是否属于国家法规或国际公约、协议所允许。
（二）限制性狩猎、诱捕和采集
该原则标准条款2要求，森林经营单位对森林进行保护，避免森林遭受未经许可的狩猎、诱捕和采集等活动的破坏，要求这些活动控制在合理范围内。
在认证审核中，审核员主要开展活动是：
（1）检查森林经营单位关于狩猎、诱捕和采集方面的规定。
（2）检查森林经营单位内的狩猎、诱捕和采集情况，如是否依法申请狩猎证，是否有正式允许的采集许可文件：相关活动的记录。
（3）考虑森林经营单位的猎捕量和采集量是否符合限额管理政策的规定。
（三）典型森林生态系统的保护
该原则标准条款3要求保护经营区域内典型的森林生态系统类型，它包括典型天然林区、典型湿地区、典型物种原始分布区等。
在认证审核中，审核员主要开展活动是
（1）开展文件查阅和现地考察，检查森林经营单位是否存在典型生态系统，如存在，则进一步检查是否确立了典型生态系统，相关的图表和文档资料。（2）如果有典型生态系统，是否制定了相关的保护措施文件，并在现地考察确定森林经营单位是否有落实保护措施。
应注意的是，典型生态系统应科学地确立，而不是每个森林经营单位都存在典型生态系统。（四）营林性措施
该原则标准条款4是从营林作业措施的角度来考虑恢复、保持和提高森林生物多样性，它要求在森林经营活动中考虑相关的措施，并具体地举例了一些措施，如采用减少负面影响的作业方式和采用适宜的森林培育体系等。
在认证审核中，审核员主要应检查营林作业措施规定（或作业指南），开展实地考察，访谈作业人员和当地社区，了解森林经营措施对生境、生物多样性的负面影响程度大小，森林作业体系是否合适。
