1.产品管理组织的设置会在企业内部产生一些冲突或摩擦。一方面因为产品经理所拥有的权利往往小于他们承担的责任，他们得主要靠劝说的方法来影响诸如生产部门、广告部门、销售部门等其他各职能部门与他配合，他们常常被人看作低级别的协调者。大量的时间得花在各种协调会议、日常文书等工作上。另一方面各产品经理相互独立，他们会为保持各自产品的利益而发生摩擦。
2.产品经理有时会过分强调短期成果。公司内部的人常常抱怨，产品经理在追求一个季度或更短时期内的销售量和市场份额目标时表现得过于短视。由于产品经理只对产品的研制、市场开发和销售行使有限的权力，但却要对利润负责，这势必会形成一种矛盾。
3.产品管理组织所需的费用常常高出预算。此外，产品经理还有可能过分关心产品而忽视了顾客。并非所有的企业都必须设置产品经理，只有一条产品线和一个市场，或者整个经济活动已被分散化，在这两种情况下，产品经理会是多余的。当企业生产越来越多的产品销售给不同的顾客群，以及更多的竞争者加入了竞争行列，企业对产品管理组织结构的需求才会越来越迫切。
