在知识经济的时代，组织的设计也不可能与传统组织相同，以下是现代组织设计的一些主要方向：
1.要坚持专业化的机构类型。所谓专业化就是使企业向着专业化规模发展，形成规模经济，促使企业专业化水平的提高和成本的降低。这是一种理想模式。
2.组织机构现化化要突出关键职能。关键职能就是将生产、技术、开发、销售、财务、人事等职能中，对实现企业任务和战略起关键性作用的职能部门找出来，在机构设置上，不是平起平坐。这是组织成功的重要条件。关键职能部门不是绝对的，这是由企业的经营战略决定的。不同的战略，它的关键职能部门不一样，所以，有多种组织机构形式。常见的有以下几种：（1）以质量为中心的组织模式（质量效益型），就是把质量管理部门作为一个关键职能部门看待。多适用类似家电行业的企业。（2）以开发为中心，突出对新品、新技术的开发。主要适用于高新技术企业，典型的如电子计算机制造企业、精密仪表企业、生物工程等。（3）以销售为中心，将企业的销售部门作为关键部门。这个模式多适用于轻工业企业，如服装、食品、造纸等。这种轻工企业基本都是以销售为中心，将销售部门作为关键部门，销售渠道畅通了，企业就会掌握自身发展的主动权。
3.职能机构综合化。就是说一个部门，不再是单一职能，要走向综合职能。它不是简单的数量扩大，关键在于职能是综合化的。销售、原料准备、计划、生产等职能都在一个部门内，职能、机构是综合的。这是现代企业组织发展一个方向。
4.二级单位组织形式多样化。如果企业很大，除总部以外，在总部下面有二级单位，如分公司、子公司、派出单位，组织机构多种多样。关键是二级单位采取什么样的组织形式，国际通用模式基本分为三种模式：（1）职能制。二级单位附带某个职能，可能是生产职能，也可能是销售职能，也可能是其他职能。国际代号称为“U”型结构（United）属统一式的；（2）事业部制。附带某个事业。国际代号称做“M”型结构（Multiplication structure），多部门式的；它是按产品或地区来设置二级单位的。（3）子公司制。代号是“H”结构（Holding），是控股式的。
5.企业组织机构要坚持单职制，就是企业中尽量少设或不设副职。现代组织理论强调扁平型结构，不设副职实际上是少了一个层次。
5.企业组织机构要坚持单职制，就是企业中尽量少设或不设副职。现代组织理论强调扁平型结构，不设副职实际上是少了一个层次。
6.业务流程合理化问题。业务流程就是管理流程。合理化的结果必然带来机构的重组，引起组织变革。
7.组织机构设计要增加适应性。市场经济条件下不仅要求企业的效率高，还要求对市场反应灵敏。增加企业适应性，主要有以下几个措施：（1）各企业部门都要增加对外联系的职能。（2）加强协调和综合职能。（3）增加组织机构的柔性。
